Mezoterapi, sebebi belirlenemeyen ve atak haline gelen ağrılar için uygulanabilir. Çeşitli ilaçlar bir araya getirilerek hazırlanan mezoterapi kokteylleri ağrının olduğu bölgelere uygulanır ve böylece ağrının kontrol altına alınması hedeflenir. Zona, migren, romatizma, stres, menisküs patolojileri ile kas-eklem problemleri kaynaklı ağrıların tedavisinde kullanılabilir. Mezoterapi ayrıca bir çok saç ve cilt probleminin tedavisi için de uygulanabilir.